但該文件也明確表示，這些限制不會影響牛津納米孔對csgg的使用。csgg是相關(guān)訴訟開始后不就，牛津納米孔發(fā)布的另一種新孔，基于全新的序列，其研發(fā)工作是否依靠illumina公司的專利技術(shù)依然是謎。
納米孔測序比傳統(tǒng)測序更便攜和實(shí)惠，主要根據(jù)單核苷酸通過孔隙產(chǎn)生的電流變化檢測dna序列。2014年，牛津納米孔推出了第一款商業(yè)化的納米孔測序儀——minion。而今年年初，illumina公司在一份聲明中稱牛津納米孔的minion和promethion設(shè)備侵犯了自己的專利。
illumina公司起訴牛津納米孔使用細(xì)菌驅(qū)動孔隙——恥垢分枝桿菌孔蛋白a（mspa）侵犯了其msp納米孔和相關(guān)方法專利，稱其產(chǎn)品與mspa至少有68%的相似點(diǎn)。
據(jù)悉，2010年，美國華盛頓大學(xué)的jensgundlach首次證明mspa可用于dna測序，并與阿拉巴馬大學(xué)微生物學(xué)家michaelniederweis合作證明mspa孔隙結(jié)合“棘輪系統(tǒng)”便可讀取短dna序列。2013年，illumina公司從阿拉巴馬大學(xué)和華盛頓大學(xué)獲得納米孔測序技術(shù)授權(quán)。
這場專利之爭引起了使用牛津納米孔產(chǎn)品研究人員的密切關(guān)注。他們擔(dān)心失去納米產(chǎn)品或?qū)＠麘?zhàn)會扼殺新平臺發(fā)展。而且，由于相關(guān)技術(shù)的細(xì)節(jié)仍然保密，有可能導(dǎo)致專利訴訟陷入膠著。
不過，杜克大學(xué)專利法專家artirai表示，“本應(yīng)該將一些公正帶入該體系，因?yàn)橛袝r單靠語句，人們很難明確地知道你發(fā)明了什么。這是一個模糊的領(lǐng)域。”她還指出，最有可能的是，兩個公司最終達(dá)成一致。
如果牛津納米孔選擇繼續(xù)打官司，那它必須向法官和陪審團(tuán)展示其設(shè)備背后的秘密。最后，該公司選擇宣布了升級設(shè)備——r9。r9實(shí)際上是csgg，來源于大腸桿菌的蛋白膜，在核苷酸通過孔隙時，這種蛋白比版本r7有更好的識別力。
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